НИИ Антропогенеза (ARI)

2022-06-23 15:21:15 https://olegchagin.livejournal.com/4484677.html Открыть/Комментировать

2022-06-23 15:13:24 https://teletype.in/@anthropogenesisresearchinstitute/Gtxdf4IbWIq Открыть/Комментировать

2022-06-23 15:10:24 https://teletype.in/@anthropogenesisresearchinstitute/GKniqzHo9qP Открыть/Комментировать

2022-06-23 14:59:08 Исследователи AIRI обучили нейросетевую модель на самой полной на сегодняшний день сборке генома человека

Модель GENA_LM, выложена в open source и доступна биологам по всему миру
В данный момент в мире уже представлен набор достаточно хороших моделей для последовательностей белков (например, ESM), но для последовательностей ДНК публично доступна только разработанная коллективом ученых из США модель DNABERT

GENA_LM – первая в мире языковая модель ДНК, обученная на самой полной версии генома человека (T2T-CHM13), которая была опубликована в конце марта 2022 года
Она может обрабатывать последовательности в 6 раз длиннее, чем DNABERT

Опубликованная модель – это первый шаг исследования
Впереди эксперименты по применению трансформерных архитектур с памятью, которые позволят увеличить размер входной последовательности ещё в несколько раз

Репозитории с моделью GENA_LM:
Hugging Face
GitHub Открыть/Комментировать

2022-06-23 14:24:40 Открыть/Комментировать

2022-06-23 14:23:25 https://olegchagin.livejournal.com/4484598.html Открыть/Комментировать

2022-06-23 14:14:21 https://teletype.in/@anthropogenesisresearchinstitute/gv8mt2fQXwy Открыть/Комментировать

2022-06-23 14:11:18 Человек потерял запятую, стал бояться сложных предложений
Искал фразу попроще

За несложными фразами пришли несложные мысли
Потом он потерял знак восклицательный и начал говорить тихо, с одной интонацией

Его уже ничто не радовало и не возмущало, он ко всему относился без эмоций

Затем он потерял знак вопросительный и перестал задавать всякие вопросы
Никакие события не вызывали его любопытства, где бы они ни происходили — в космосе, на Земле или даже в собственной квартире

К концу жизни у него остались только кавычки
Он не высказывал ни одной собственной идеи, он все время кого–нибудь цитировал — так он совсем разучился мыслить и дошел до точки Открыть/Комментировать

2022-06-23 14:10:05 Идет набор студентов на магистерскую программу «Структурная биология и биотехнология» биофака МГУ

Программу возглавляет Екатерина Люкманова, профессор кафедры биоинженерии биологического факультета МГУ, заведующая лабораторией биоинженерии нейромодуляторов и нейрорецепторов ИБХ РАН.

Кураторы программы:
• Курт Вютрих, нобелевский лауреат 2002 года по химии за создание метода ЯМР-спектроскопии белковых молекул;
• Михаил Петрович Кирпичников, академик РАН, декан биологического факультета МГУ и идейный лидер структурной биологии в России;
• Александр Сергеевич Арсеньев, заведующий отделом структурной биологии ИБХ РАН и один из пионеров ЯМР в России;
• Ольга Сергеевна Соколова, профессор кафедры биоинженерии биологического факультета МГУ, руководитель группы структурной биотехнологии

Занятия ведут действующие ученые, ведущие специалисты в области молекулярной и структурной биологии, сотрудники МГУ, МФТИ и институтов РАН
Программа полностью охватывает все известные методы структурной биологии (РСА, ЯМР, крио-ЭМ, ММ). Практикумы проходят в лабораториях ИБХ, Курчатовского института и ФИЦ «Биотехнология»

В программу входят регулярные научные семинары с руководителями, курсы по презентации данных и написанию научных статей, а также участие в молодежных школах по структурной биологии
Студенты получат навыки, необходимые в том числе для работы в области разработки лекарственных препаратов
Для студентов-бюджетников предусмотрены именные стипендии в размере ₽20.000
По результатам семестра одному из студентов будут назначены поощрительные выплаты от биофака МГУ в размере ₽10.000
Прием документов для поступления в магистратуру открыт с 15 июня по 22 июля 2022 года

Подробная информация на сайте программы>>
Контакты:
Люкманова Екатерина Назымовна
Email: ekaterina-lyukmanova@yandex.ru Открыть/Комментировать

2022-06-23 14:06:46 Восстанавливающий агент
Часто в биохимической практике его используют для восстановления дисульфидных связей в молекулах белков

Кстати, вопреки внутреннему словесному чувству, под восстановлением дисульфидных связей понимают их разрыв, а не образование

Это любопытное вещество имеет не менее любопытное название
Вопреки внутреннему словесному чувству, это слово пишется именно с буквой Е: дитиотрЕитол

Это связано с тем, что префикс ТРЕ происходит от названия углевода ТРЕОЗА (в молекуле которой, вопреки внутреннему словесному чувству, четыре атома углерода, а не три)

Префикс "тре-" обозначает определённый характер пространственного расположения заместителей в молекуле

Кроме того, аббревиатура дитиотреитола - ДТТ

Нельзя путать это с ДДТ - дихлордифенилтрихлорэтаном, который применяется при борьбе с насекомыми (инсектицид) Открыть/Комментировать