Genotek

2022-04-15 10:01:38 29 марта 2022 года в журнале Nature Communications вышла статья о механизме отключения генов.

Ученые из Австралии создали в эмбриональных стволовых клетках самки мыши систему под названием «Рождество». Для этого в генетический материал были введены гены красного и зеленого флуоресцентного белка: одна Х-хромосома содержала ген красного белка, вторая Х-хромосома содержала ген зеленого белка. Эта система сообщала об активности генов с помощью красного и зеленого свечения: если в клетке были активны обе Х-хромосомы, то клетка светилась и красным, и зеленым, при выключении одной из Х-хромосом (в ходе естественного процесса инактивации, происходящей в клетках самок всех млекопитающих), наблюдалось либо красное, либо зеленое свечение. Похоже на рождественскую гирлянду, правда? Но это еще и позволило отделить клетки с неактивной Х-хромосомой по свечению и изучить их.

Отключение генов регулируется плотностью упаковки ДНК. Если она неплотно упакована, гены могут быть включены (к ним есть доступ специальных ферментов); когда она плотно упакована, гены выключены. В новом исследовании ученые обнаружили, что ДНК должна сначала раскрыться, прежде чем она сожмется, и ген этого участка выключится, подобно тому, как аккордеон должен раскрыться, прежде чем он будет сжат, чтобы произвести музыкальную ноту. Также они определили белковый комплекс, необходимый для этого процесса, известный как комплекс BAF.

Понимать, как происходит выключение генов в клетках важно, например, для разработки лекарств. Исследовав этот процесс и научившись им управлять, можно будет отключать онкогены, которые приводят к развитию рака. https://www.nature.com/articles/s41467-022-29333-1 Открыть/Комментировать

2022-04-15 10:01:37 Открыть/Комментировать

2022-04-14 13:00:50 65 лет назад в журнале Nature были опубликованы три статьи, посвященные открытию структуры ДНК. Отпразднуйте это событие вместе с нами!

Закажите до 25 апреля включительно Генетический паспорт всего за 7990 ₽, а один раздел Происхождение — всего за 4990 ₽. Акционная цена появится в корзине после введения промокода DNAday2022.

Генетический паспорт — это комплексный ДНК-тест, который расскажет о вашем происхождении и здоровье. Он включает разделы:
Происхождение
Риски заболеваний
Питание
Спорт
Способности и характер
Эффективность лекарств
+ Консультация врача https://www.genotek.ru/ Открыть/Комментировать

2022-04-14 10:00:44 В новом выпуске подкаста «Просто такая генетика» мы поговорили про сон и память.
Зачем мы спим почти треть жизни?  Как влияет сон на нашу память? Что такое генетическая память? Как избавиться от бессонницы и какие хронотипы существуют сегодня?

Эти и другие вопросы мы обсудили с нашими гостями: Александром Калинкиным –  руководителем Центра медицины сна Медицинского научно-образовательного центра МГУ им. М.В. Ломоносова и Ольгой Сварник – нейрофизиологом, кандидатом психологических наук, ведущим научным сотрудником лаборатории психофизиологии имени  В.Б. Швыркова Института психологии РАН.

Смотрите выпуск на YouTube


Или слушайте на любой из площадок:
Apple Podcasts https://apple.co/3qgHhRh
Google Podcasts https://bit.ly/362WX2W
Яндекс.Музыка https://bit.ly/3oWBwIo
Spotify  https://clck.ru/aiYdh

Подписывайтесь и оставляйте комментарии под выпусками. Открыть/Комментировать

2022-04-13 10:00:50 Знаете ли вы, от чего зависит хронотип человека?

Под хронотипом понимают предпочтительное время сна и бодрствования, независимо от внешних факторов, например, от режима работы. Крайние точки — это так называемые жаворонки и совы. Жаворонки предпочитают просыпаться рано утром и наиболее активны в начале дня. Есть данные, что у жаворонков меньше суточный (циркадный) цикл, который в среднем у человека составляет 24,2 часа. Совы предпочитают просыпаться поздно и чувствуют себя наиболее активными вечером и ночью. Также есть данные, что это связано с увеличением продолжительности их циркадного цикла. Исследования показали, что хронотип может меняться в течение жизни: дети обычно жаворонки, подростки и молодые люди — совы, а по мере взросления опять становятся жаворонками.

Исследования близнецов и семей оценили генетический вклад в формирование хронотипа примерно в 50%. Несколько генов показали связь с хронотипом, например, PER1, PER2, CLOCK и ARNTL2. Но наиболее изученной является связь хронотипа с вариантами длины гена PER3. Этот ген может иметь 4 или 5 повторов участка из 54 пар нуклеотидов. Такая вариация длины обнаружена только у приматов. Люди могут быть гомозиготными (4/4 или 5/5) или гетерозиготными (4/5) по количеству повторов. 5-повторный аллель положительно связан с хронотипом "жаворонок" и более ранним воздействием мелатонина в сумерках. Открыть/Комментировать

2022-04-13 10:00:50 Открыть/Комментировать

2022-04-12 10:03:01 28 марта 2022 года в журнале The CRISPR Journal вышла статья о методе создания гипоаллергенных кошек.

Ученые из США с помощью редактирования генома CRISPR-Cas9 смогли “выключить” ген основного кошачьего аллергена в культуре клеток. Это выделяемый слюнными, сальными, перианальными и слезными железами кошек белок Fel d 1, две части которого кодируют два гена CH1 и CH2. Уровни аллергена могут более чем в 100 раз различаться между кошками и даже у одной и той же кошки в разное время. Компьютерный анализ показал, что гены этого аллергена очень изменчивы среди кошачьих, а значит они не являются ключевыми и их выключение не сильно повлияет на жизнь кошки. Сначала ученые определили наиболее важные места в генах аллергена, а потом “выключали” либо один, либо другой. Эффективность в этом эксперименте достигла 55%, и не было обнаружено влияния этой процедуры на другие гены.

Аллергией на домашних кошек страдает до 15% населения. Симптомы могут различаться, вплоть до тяжелой астмы. Но современные методы лечения имеют ограниченный эффект. Например, корм для кошек с антителом против аллергена снижает уровень аллергена на шерсти кошек на 47%. Вакционирование кошек против Fel d 1 (вакцина HypoCat ) уменьшает на 50% уровень аллергена, что облегчает на 30% тяжесть симптомов у пациентов с аллергией. Антитела против Fel d 1, введенные пациентам с аллергией, снижают тяжесть симптомов на 60% у 50% пациентов. Но это всё небольшое облегчение для людей с аллергией на кошек. Особенно учитывая, что почти у всех людей с аллергией на кошек симптомы начинают появляться при содержании аллергена 8  мкг на грамм домашней пыли, в то время как аллерген может накапливаться >1000  мкг/г. 

Поэтому новое исследование предлагает подход выключения полностью генов аллергена у кошек, что может привести к отсутствию проявлений аллергии у людей. Пока исследование проведено только на культуре клеток, но ученые планируют провести его на животных. https://www.liebertpub.com/doi/10.1089/crispr.2021.0101 Открыть/Комментировать

2022-04-12 10:03:01 Открыть/Комментировать

2022-04-11 10:04:16 Сейчас Среднее Поволжье включает Татарстан, Чувашию, Нижегородскую, Пензенскую, Ульяновскую и Самарскую области, а раньше эта территория была частью Волжской Булгарии. 

Волжской Булгарией называют историческое государство, которое было расположено в Среднем Поволжье и бассейне реки Камы с 10 по 13 век. Считается, что его основали булгары, которые пришли из причерноморских и азовских степей (из Великой Булгарии). 

До прихода булгар на этой территории проживали балто-славянские, тюркоязычные и финно-угорские племена, которые потом частично вошли в состав Волжской Булгарии. В 13 веке после нескольких сражений Волжская Булгария вошла в состав Золотой Орды. Географически на территории, на которой раньше располагалась Волжская Булгария, сейчас проживают татары, чуваши, башкиры и мордва.

Продолжаются споры о народе, являющемся потомком волжских булгар. Многие отводят эту роль поволжским татарам. Исследование их генофонда и сравнение с генофондом других групп татар показало, что Y-хромосомная ДНК поволжских татар не только отличается от ДНК сибирских и крымских татар, но и на большую часть представлена линиями, распространенными в Волго-Уральском регионе и на Восточно-Европейской равнине. Меньшая доля линий принадлежит к средиземноморским и переднеазиатским. И менее 5% составляет вклад восточных гаплогрупп. Также как и остальные группы татар, поволжские татары далеки от монгол: их генофонд в 55 раз ближе к генофонду башкир, чем монголов. Открыть/Комментировать

2022-04-11 10:04:15 Открыть/Комментировать