Получи случайную криптовалюту за регистрацию!

Корабли мутировали-мутировали… У вас есть две подводные лодки | Не Новичок

Корабли мутировали-мутировали…

У вас есть две подводные лодки, одинаковые во всём, кроме одного: одна внутри разделена переборками на 92 герметичных отсека, а вторая – на 215. По этим лодкам ведут огонь. Торпеды южноафриканские маломощные, но гарантированно делают небольшую пробоину.
Внимание, вопрос: какая из подводных лодок имеет больше шансов пойти ко дну после 10 южноафриканских торпед?

Правильный ответ: та, у которой меньше отсеков. Был бы один, то затонула бы после первого же попадания. Чем больше дробление, тем выше живучесть.

Это – модель Т-клеточного иммунитета, причём Т-хелперное (CD4) звено – это лодка с 92 отсеками, а Т-киллерное (CD8) – с 215. Если для вас в предыдущем предложении знакомы только слова «модель», «лодка» и «отсек», то вам необходимо ознакомиться с вот этим, этим и вот этим постами.

В них мы писали, что ключевым этапом для активации CD4 или CD8 клеток является презентация антигена на главном комплексе гистосовместимости, он же ГКГС, он же МНС, он же HLA. В случае Т-хелперов вирус расчленяется антигенпрезентирующей клеткой, и кусочки сервируются на HLA II типа. Если Т-хелпер распознаёт презентированный антиген, то он активируется, саморазмножается и идёт помогать В-клеткам вырабатывать антитела к этому антигену.

В случае Т-киллеров обычная клетка, отчитываясь о том, что она производит, сама кромсает отработанные белки на части и выставляет на HLA, но уже I типа. Если Т-киллер распознаёт на мембране клетки чужеродный антиген, он тоже активируется, и начинает размножаться как те гремлины, на которых брызнули интерлейкином-2 водой. Новая армия CD8+ клеток отправляется досматривать HLA I клеток на предмет таких же антигенов.

Причём же здесь 92 и 215? Дело в том, что тарелочки, на которых сервируются порезанные вирусные белки, HLA I и II, различаются по вместимости. На первый тип HLA умещается стейк размером 9-10 аминокислот, а на второй – 13-17. Проще говоря, нарезка для Т-хелперов в два раза крупнее. Поэтому из S-белка, состоящего из 1200+ аминокислот получается 92 куска, пригодных для распознавания Т-хелперами и в два раза больше для тренировки Т-киллеров.

Что это значит на практике? В случае мутаций в S-белке система Т-хелперов, как та подлодка, более уязвима. Если у человека есть антитела к уханьскому варианту коронавируса, то часть из них не будет работать по южноафриканскому варианту. Если в нарезке на HLA II изменилась всего одна аминокислота, весь этот кусок не будет распознаваться тренированными Т-хелперами, и организму придётся нарабатывать антитела с нуля.

А если то же количество мутаций-торпед попадёт в Т-киллерное звено, то урон будет значительно меньше. Десять выпавших эпитопов из 215 – это менее драматично, чем 10 из 92. Это очень наглядно демонстрируется в одном крайне любопытном мартовском препринте.

В исследовании Т-клеткам переболевших уханьским вирусом показывали мутантные варианты, и смотрели на их реакцию. В отношении южноафриканского варианта CD4-клетки были активны только на 75,3%. А вот CD8- клетки сохраняли активность на уровне 97,6%. На практике это означает, что ЮА-вариант может убегать от антительного ответа, который формируется при помощи CD4-клеток, но избежать налоговой инспекции в виде Т-киллера не получится.

Именно поэтому не стоит причитать, если антитела из плазмы привитых векторными или РНКовыми вакцинами не так бодро нейтрализуют новые варианты SARS-CoV-2. Надо смотреть эпидэффективность.

Вторым важным пунктом этого препринта было то, что % активных CD4-клеток у вакцинированных был 0,15-0,19%, а у переболевших в два раза меньше: 0,09-0,1%. Ещё больше разница по Т-киллерам: 0,16-0,24% и 0,08-0,11% соответственно.

Есть, конечно, у этого исследования свои ограничения: не самая крупная выборка, 75% которой – женщины, обширное использование сложного моделирования и ещё ряд моментов. Но в целом это хороший знак для вакцин, индуцирующих CD8-ответ. А это м-РНК и векторные.

А пока продолжаем наблюдение. Искренне ваш, (под)опытный колик.