(sci)Berloga Всех Наук и Технологий

2022-08-30 16:04:36 @SBERLOGACOMPETE webinar on data science:
Кирилл Вышегородцев (Sber) "DeepFake. Актуальные угрозы и методы обнаружения"
Thursday 01 September, 19.00 (Moscow Time)

Google calendar link

Рассмотрим существующие подходы к созданию DeepFake. Какие угрозы несет данная технология, так ли она безобидна, как может сначала показаться? Какие современные проблемы стоят перед исследователями при выявлении DeepFake. Рассмотрим разработанную технологию Сбера, сравнение ее эффективности с современными СОТАми и направления для ее применения.
патент №2768797

Ссылка на зум будет доступна в канале: https://t.me/sberlogabig ближе к началу доклада. Открыть/Комментировать

2022-08-30 09:23:14 @SBERLOGACOMPETE webinars on Kaggle competition ("Open Problems - Multimodal Single-Cell Integration"):

Kseniya Petrova "Brief introdction to the competition on multimodal data"
Tuesday 30 August , 19.00 (Moscow Time)
Google calendar link
We will briefly discuss the competition data, metrics, compare it with some previous competitions.

Larisa Okorokova (Université Côte d'Azur) "Introduction to the biological
story behind the Open problems in single cell analysis 2022 competition"
Wednesday 31 August , 19.00 (Moscow Time)
Google calendar link
We will briefly discuss the biological side of the competition data

Zoom link will be available in the chat https://t.me/sberlogacompete shortly before the talk. Открыть/Комментировать

2022-08-29 08:33:11 @SBERLOGACOMPETE webinar on Kaggle:
Andrew Lukyanenko (Kaggle Grandmaster) "Getting started with Kaggle"
Monday 29 August , 18.00 (Moscow Time)

Google calendar link

This is an introduction to Kaggle for those, who don't have experience with the platform. I'll talk about main parts of the Kaggle and give some advice as well as warnings.

Zoom link will be available in the chat https://t.me/sberlogacompete shortly before the talk.

Ссылка на зум будет доступна в чате: https://t.me/sberlogacompete ближе к началу доклада. Открыть/Комментировать

2022-08-28 17:41:03 "Новая активность - соревнования." В дата сайнс комьюнити все знают, что один из лучших способов учиться дата сайнс - принимать участие в соревнованиях на Каггл. Мы открываем новый чат https://t.me/sberlogacompete - посвященный любым соревнованиям по дата сайнс, биоинформатике - добавляйтесь (если вам интересны соревнования или просто дата сайнс) ! А если вы биолог и ничего не знаете о ДС (и/или не хотите знать), то - все равно добавляйтесь . И вот почему:

"Пет проект(ы). Написание статьи вместе с биологами." Предлагаем организовать "пет-проект(ы)" с возможным выходом - написание статьи совместно с биологами - вокруг нового соревнования на каггл - по биоинформатике и дата сайнс - анализ мультимодальных одноклеточных данных. (Например, подобно этой статье, где весь анализ сделан на Каггл, и в которой некоторые из нас участвовали). Данные соревнования - получены по самым современным технологиям, аналогов которых - мало. Их анализ (в перспективе), может дать лучшее понимание работы клеток, улучшение в разработке лекарств и т.д. Поэтому - биологи - welcome please !

Про Kaggle (блеск и ужас). Для тех, кто не в курсе, чем Каггл прекрасен (и чем ужасен): это площадка для ДС-соревнований, которая за 12 лет привлекала к себе уже сотни тысяч дата сайнтистов. Он прекрасен, тем, что люди постоянно делятся своими решениям, своим кодом, своими данными - вы можете смотреть, что делают другие, учиться у них, задавать вопросы, обсyждать. На Kаггл действует система поощрения - люди голосуют за код и обсуждения других, и есть звания: Каггл эксперт, мастер, грандмастер. Звание Каггл мастер/грандмастера (особенно в номинации "соревнования") ценится в дата сайнс комьюнити (во всем мире) и помогает найти хорошую работу. Но есть и "темная сторона": физкультура это хорошо, а вот профи-спорт это ... Если вы слишком сильно захотите "медалей" и званий Каггл - это другое - это спорт ради спорта . Это тяжелый труд 24*7, разочарования, постепенное понимание различных ньюансов именно соревновательного дата-сайнс, который не нужен нигде кроме соревнований и так далее. Посмотрите вот этот пост - и это так у большинства.

Что предлагается делать в рамках "пет-проекта(ов)"? Идея в том, чтобы взять "светлую" сторону Каггл, и обойти стороной "темную" сторону. Предлагается посмотреть эти данные, литературу, как минимум сделать бенчмарк известных методов и тех методов, которые предложат Кагглеры, попытаться понять насколько мы видим биологический эффект, а не батч эффект этого конкретного датасета (тут нужны биологи)... А как максимум - получить Нобелевскую премию (шутка ). Также организуем вебинары, журнальные клубы, обсуждения - будем делиться опытом. Если у кого будут получаться хорошие решения - они молодцы, но стремиться к золоту любой ценой - этого делать не стоит, намного полезнее (и проще) разобраться в каких-то научных вопросах связанных с этими данными и написать статью, чем тратить уйму времени на улучшение скора на бессмысленный 0.00....0001 процент, чтобы попасть в золото. Посмотрите более подробные посты тут: Каггл1, Каггл2, Каггл3. Первые доклады уже анонсированы - см. https://t.me/sberlogabig/142 - начнем с рассказа известного многим Каггл Грандмастера Андрея Лукьяненко - что такое Каггл и с чем его едят. )

Присоединяйтесь к https://t.me/sberlogacompete будет весело ! Открыть/Комментировать

2022-08-27 15:12:02 Видео записи докладов по дата сайнс и биоинформатике
(Как вам новый дизайн фронта Ютуб канала: https://www.youtube.com/c/SciBerloga ? ):
Подписывайтесь и ставьте лайки. Видео, которое наберет большего всего лайков - получит приз от Сберлоги.
Голосуйте - все завист от Вас ! )

Татьяна Шаврина (AIRI, Sberdevices) «Многоязычное приключение или как мы учили mGPT: многоязычная модель GPT-3 для 61 языка мира»
Видео:


Абстракт: https://t.me/sberlogabig/137
Материалы: https://t.me/sberlogasci/3879

Елизавета Герасева (ФББ МГУ) «Дизайн нуклеаз для редактирования генома»
Видео:


Абстракт: https://t.me/sberlogabig/139
Материалы: https://t.me/sberlogabio/38467

Никита Рокотян «Как визуализировать граф с миллионом узлов»
Видео:


Статья с use case в анализе транзакций в блокчейне: https://medium.com/@cosmograph.app/6846dec7f1d7
https://t.me/sberlogabig/129

Илья Зубарев «Глаза и уши клетки: Как мы воспринимаем мир»
Видео:


Материалы: https://t.me/sberlogabio/37408
Абстракт: https://t.me/sberlogabig/130

Александра Далина «Основы проточной цитометрии»
Видео:


Материалы: https://t.me/sberlogabio/37821
Абстракт: https://t.me/sberlogabig/134

Илья Ясный «Современные лекарственные разработки»
Видео:


Материалы: https://t.me/sberlogabio/38204
Абстракт: https://t.me/sberlogabig/136

PS

Несколько позднее будет важный анонс. Мы начнем активность вокруг нового каггл соревнования посвященного анализу cutting-edge technology биологических данных - с потенциальным выходом - написание статьи. Хотите позаниматься дата сайнс и биоинформатикой в хорошей компании и, конечно, с перспективой спасти мир от всех болезней (легкое преувеличение))) - присоединяйтесь к @sberlogacompete .
(Группа пока в тестовом режиме - писать сообщения - можно будет позже).

Запланированы доклады (Planned free webinars):

Andrew Lukyanenko (Kaggle Grandmaster) "Getting started with Kaggle"
Monday 29 August , 18.00 (Moscow Time)
Google calendar link

Larisa Okorokova (Université Côte d'Azur) "Introduction to the biological
story behind the Open problems in single cell analysis 2022 competition"
Wednesday 31 August , 19.00 (Moscow Time)
Google calendar link Открыть/Комментировать

2022-08-24 12:35:19 @SBERLOGABIG online seminar on biology:
Елизавета Герасева (ФББ МГУ) «Дизайн нуклеаз для редактирования генома»
Пятница 26 августа, 18.00 по Москве

Доклад будет посвящен методу редактирования генома с помощью внесения сайт-специфичных двуцепочечных разрывов. Будут вкратце разъяснены механизмы, лежащие в основе этого метода, рассмотрены основные типы используемых нуклеаз, история и особенности их применения, подходы к модификации их специфичности.

Литература:
https://www.nature.com/articles/nmeth.1807 https://www.science.org/doi/abs/10.1126/science.1231143 https://academic.oup.com/genetics/article/161/3/1169/6052563 https://www.nature.com/articles/nbt.1755 https://www.nature.com/articles/nature04818

Видео:


Материалы: https://t.me/sberlogabio/38467 Открыть/Комментировать

2022-08-22 14:58:23 @SBERLOGABIG online seminar on data science:
Татьяна Шаврина (AIRI, Sberdevices) «Многоязычное приключение или как мы учили mGPT: многоязычная модель GPT-3 для 61 языка мира»
Четверг 25 августа, 18.00 по Москве

В докладе мы расскажем о проблемах, которые возникали во время обучения мультиязычной модели, посмотрим ее архитектуру, способы оценки — и дальнейшее развитие.

О докладчике: Татьяна Шаврина,
Главный эксперт по технологиям, RnD NLP, SberDevices
Руководитель исследовательских проектов, AI Research Institute.
Автор тг канала: @rybolos_channel - подписывайтесь !

Литература:
mGPT paper https://arxiv.org/abs/2204.07580
HuggingFace: huggingface.co/spaces/sberbank-ai/mGPT
Repo: https://github.com/ai-forever/mgpt

Доп материалы:
Scaling Laws for Neural Language Models, Kaplan et al. OpenAI 2020
https://arxiv.org/abs/2001.08361
XGLM https://arxiv.org/abs/2112.10668


Видео:


Материалы: https://t.me/sberlogasci/3879 Открыть/Комментировать

2022-08-19 20:57:44 @SBERLOGABIG online seminar on biology:
Илья Ясный «Современные лекарственные разработки»
Понедельник 22 августа, 18.00 по Москве
( ! Нестандартный день ! )

Абстракт: речь пойдет о том, как в настоящее время происходит разработка лекарств, каковы самые яркие достижения биофармацевтики сегодня, какие технологии наиболее перспективны в плане будущих разработок.

Докладчик: руководитель научной экспертизы LanceBio Ventures, автор и редактор «Биомолекулы», автор «XX2 века»

Видео:


Материалы: https://t.me/sberlogabio/38204
Материалы от Ильи на Биомолекуле:
From Ilya Yasny to Everyone 06:22 PM
https://biomolecula.ru/specials/doklinika
https://biomolecula.ru/specials/clinical-trials
https://biomolecula.ru/specials/sovremennye-lekarstva
https://biomolecula.ru/specials/otkrytye-innovacii Открыть/Комментировать

2022-08-15 15:27:20 @SBERLOGABIG online seminar on biology:
Александра Далина «Основы проточной цитометрии»
Пятница 19 августа, 18.00 по Москве

Эта лекция посвящена проточной цитометрии - методе, позволяющем массово охарактеризовать отдельные клетки и даже их отсортировать, - и рассчитана на тех, кто не знаком с ней. Будет рассказано о принципе действия, ее видах, базовой настройке и рутинной работе на приборе, приведены примеры некоторых конкретных задач, которые можно решать с ее помощью.

Спикер: Александра Далина, сотрудник центра высокоточного редактирования и генетических технологий для биомедицины, Института молекулярной биологии РАН. Личный тг-блог: @almeisan

Видео:


Материалы: https://t.me/sberlogabio/37821 Открыть/Комментировать

2022-08-12 20:50:25 Открыт набор на второй поток практического курса PCR.NEWS

Введение в технологии NGS. Работа с данными секвенирования

Даты проведения: с 19 сентября — 24 сентября 2022 года
Формат: очно (Москва) / онлайн

Под руководством опытных преподавателей вы будете работать в командной строке Linux и Rstudio, взаимодействовать с сервисами и базами данных для поиска и анализа результатов секвенирования

По окончании курса вы сможете самостоятельно:

собирать геном из «сырых» данных секвенирования
аннотировать точечные мутации и выявлять их фенотипические проявления
идентифицировать сплайс-варианты
работать с данными секвенирования РНК
определять дифференциально экспрессируемые гены
проводить статистический анализ экспрессии генов

Курс специально разработан для тех,кто не имеет большого опыта работы с данными секвенирования. Выдается удостоверение о переквалификации.

Успейте записаться на курс до 31 августа и получите скидку 20% при раннем бронировании

Регистрация на курс: https://biomedschool.ru Открыть/Комментировать