Реконструкция генетической истории ашкеназов #генетика_РА Н | Расовая антропология
Реконструкция генетической истории ашкеназов
#генетика_РА
Новое исследование генетических корней евреев ашкеназов подтвердило смешанное европейско-ближневосточное происхождение популяции. В составе европейского предкового компонента наиболее существенный генетический поток ашкеназы получили из Южной Европы.
Происхождение евреев-ашкеназов остается спорным вопросом для специалистов, так как надежные исторические источники отсутствуют. В генетических исследованиях показано, что в генофонде ашкеназов имеются как европейский, так и ближневосточный компоненты. Но убедительная реконструкция их генетической истории до сих пор не была проведена.
В новой статье, опубликованной на сайте препринтов, авторы представили генетический анализ происхождения ашкеназов, выявив и датировав разные генетически потоки, смешавшиеся в популяции. Для этого они применили как стандартные, так и новые подходы.
В выборку, которая легла в основу исследования, вошли 2540 геномов ашкеназов, 543 европейских и 293 ближневосточных генома. Все они были генотипированы по маркерам однонуклеотидного полиморфизма (SNP) в масштабах всего генома (то есть, использовались широкогеномные данные).
Для выявления предковых составляющих в генофонде ашкеназов авторы применили несколько методов. В их числе метод LAI (local ancestry inference), который основан на сравнении в каждом индивидуальном геноме сегментов европейского и ближневосточного происхождения. Этот метод показал, что в генофонде ашкеназов около 53% европейского и около 47% ближневосточного компонентов. Другие методы привели к несколько иным цифрам, так что в итоговых оценках наблюдается значительный разброс.
Затем авторы сосредоточились на определении конкретных источников европейского компонента и для этого ближневосточный компонент «замаскировали». Они сравнили частоту различных SNP в четырех европейских регионах (Иберия, Южная Европа, Восточная Европа и Западная Европа) и смоделировали генетические потоки из каждого. В результате, Иберию они отвергли сразу как самый маловероятный источник вклада в генофонд ашкеназов.
Южная Европа оказалась доминирующим европейским источником генофонда ашкеназов, составив 60-80% от всего европейского компонента.
Датировку генетических потоков авторы вычисляли, исходя из длины фрагментов разного происхождения. Чем большая длина фрагментов осталась в геноме ашкеназов, тем более недавним был эпизод генетического вливания от другой популяции, так как со временем длинные фрагменты разбиваются рекомбинациями хромосом во время деления клетки. Используя метод IBD, исследователи подсчитывали в индивидуальных геномах ашкеназов и других популяций число фрагментов общего происхождения (IBD cегментов), особенно большой длины. Анализ показал, что по числу длинных IBD cегментов (более 7 сМ) лидирует Восточная Европа. Это свидетельство более недавнего генетического потока от этого источника.
В демографической истории ашкеназов имеется эпизод сильного сокращения численности популяции (бутылоч
Источник ВК
